потом обратно через него же(2 дня там) в Москву,тоже транзитная виза?
Думаю,что - да.
Мы, правда, только в одну сторону летели через Синг, а обратно через КЛ. Но, не вижу в чем могут быть проблемы.
По пути туда покажите билеты на Бали, по пути обратно - билеты в Москву